学校不让知网查重的主要原因包括：学校希望学生自主学习和独立思考，防止抄袭现象，保护学术诚信。解决方法可以是加强学术诚信教育，提高学生自觉性和独立思考能力，培养学生正确引用资料的习惯。

此外，学校不让知网查重还可能是为了避免学生过分依赖查重工具，提高学生对于学术论文的认真程度和研究能力。因此，学生在写作过程中应该注重原创性，避免简单复制粘贴，提高自身学术水平和写作能力。